このDokuWikiプラグインは、PubMedのPMIDを使ってNCBIから論文の情報を取得して表示します。NCBIからはEntrez Utilitiesを使ってESummary XMLファイルを取得し、 /data/media/ncbi_esummary ディレクトリ にキャッシュします。

bio plugin と cache pluginが必要です。

{{pubmed>[コマンド]:[PubMed ID]}}

短いフォーマットで論文情報を表示します。

詳しい論文情報を表示します。

NCBIから取得した生のeSummary XMLファイルを表示します。

{{pubmed>summaryXML:9039911}}

<?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE eSummaryResult PUBLIC "-//NLM//DTD eSummaryResult, 29 October 2004//EN" "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/DTD/eSummary_041029.dtd">
<eSummaryResult>
<DocSum>
	<Id>9039911</Id>
	<Item Name="PubDate" Type="Date">1997 Feb 27</Item>
	<Item Name="EPubDate" Type="Date"></Item>
	<Item Name="Source" Type="String">Nature</Item>
	<Item Name="AuthorList" Type="List">
		<Item Name="Author" Type="String">Wilmut I</Item>
		<Item Name="Author" Type="String">Schnieke AE</Item>
		<Item Name="Author" Type="String">McWhir J</Item>
		<Item Name="Author" Type="String">Kind AJ</Item>
		<Item Name="Author" Type="String">Campbell KH</Item>
	</Item>
	<Item Name="LastAuthor" Type="String">Campbell KH</Item>
	<Item Name="Title" Type="String">Viable offspring derived from fetal and adult mammalian cells.</Item>
	<Item Name="Volume" Type="String">385</Item>
	<Item Name="Issue" Type="String">6619</Item>
	<Item Name="Pages" Type="String">810-3</Item>
	<Item Name="LangList" Type="List">
		<Item Name="Lang" Type="String">English</Item>
	</Item>
	<Item Name="NlmUniqueID" Type="String">0410462</Item>
	<Item Name="ISSN" Type="String">0028-0836</Item>
	<Item Name="ESSN" Type="String">1476-4687</Item>
	<Item Name="PubTypeList" Type="List">
		<Item Name="PubType" Type="String">Journal Article</Item>
	</Item>
	<Item Name="RecordStatus" Type="String">PubMed - indexed for MEDLINE</Item>
	<Item Name="PubStatus" Type="String">ppublish</Item>
	<Item Name="ArticleIds" Type="List">
		<Item Name="pubmed" Type="String">9039911</Item>
		<Item Name="doi" Type="String">10.1038/385810a0</Item>
	</Item>
	<Item Name="DOI" Type="String">10.1038/385810a0</Item>
	<Item Name="History" Type="List">
		<Item Name="pubmed" Type="Date">1997/02/27 00:00</Item>
		<Item Name="medline" Type="Date">1997/02/27 00:01</Item>
	</Item>
	<Item Name="References" Type="List">
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 1997 Apr 3;386(6624):431. PMID: 9087392</Item>
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 1997 Apr 3;386(6624):431. PMID: 9087390</Item>
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 1997 Feb 27;385(6619):753. PMID: 9039891</Item>
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 1997 Jun 19;387(6635):754. PMID: 9194550</Item>
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 1997 Mar 13;386(6621):119. PMID: 9062180</Item>
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 1997 Mar 6;386(6620):12. PMID: 9052771</Item>
		<Item Name="Comment in" Type="String">Nature. 2006 Apr 27;440(7088):1112. PMID: 16641972</Item>
		<Item Name="Erratum in" Type="String">Nature 1997 Mar 13;386(6621):200</Item>
	</Item>
	<Item Name="HasAbstract" Type="Integer">1</Item>
	<Item Name="PmcRefCount" Type="Integer">65</Item>
	<Item Name="FullJournalName" Type="String">Nature</Item>
	<Item Name="ELocationID" Type="String"></Item>
	<Item Name="SO" Type="String">1997 Feb 27;385(6619):810-3</Item>
</DocSum>

</eSummaryResult>

リンクだけを作りたいときには、InterWiki文法を使ってもっと短く書くことが出来ます。

[[pubmed>9039911]]. → 9039911

1. bio pluginとcache pluginをインストール
2. pubmed.zipをダウンロード・解凍
3. /lib/plugins/ ディレクトリにアップロード